Le carte ninja sono delle carte contenenti informazioni codificate incise tramite il chakra. In apparenza sono delle semplici carte bianche, ma il ninja, facendole reagire col proprio chakra, è in grado di far apparire le informazioni che esse contengono. Bisogna però tenere conto che solo il chakra di chi ha “scritto” le carte è in grado di leggerle. Per quanto si conosce queste carte sono una creazione di Kabuto, che è l'unico che ne fa uso: infatti in quattro anni ha raccolto in circa 200 carte le informazioni sull'esame Chunin, ma soprattutto sui suoi partecipanti.

Durante la storia vengono mostrate solo tre carte, una che indicava il numero di Genin dei rispettivi Paesi che hanno preso parte all'esame di quell'anno e le due carte riguardanti Rock Lee e Gaara. E' probabile comunque che esistano altri tipi di carte inerenti agli esaminatori, alle prove degli anni scorsi, carte con dati come il numero di Genin che hanno superato l'esame eccetera.

Le carte riguardanti un ninja riportano molte informazioni utili: in alto sono indicati il simbolo del villaggio (es. Foglia), il kanji del Paese (es. Fuoco) e i kanji del villaggio. A destra si trova un'immagine del ninja con sotto il nome. Subito sotto si trova un riquadro nel quale probabilmente vanno inseriti gli oggetti o le armi particolari che si porta dietro il ninja. A sinistra vengono riportate alcune informazioni come l'età, il rango del ninja e il chakra, mentre subito sotto a queste si trovano le immagini dei componenti del gruppo e del maestro, con i rispettivi nomi.
In basso a destra della carta c'è l'elenco delle missioni a cui ha partecipato il ninja. Al centro c'è un grafico che indica le statistiche del ninja: la punta in alto indica il Taijustu (arti marziali), quella a destra il Ninjutsu (arti magiche) e quella a sinistra il Genjutsu (arti illusorie). L'angolo in basso a destra indica l'abilità del ninja con le armi mentre quella in basso a sinistra indica la capacità dell'abilità innata. Infine nell'angolo in basso a sinistra della carta ci sono alcune statistiche che non si sa cosa indichino esattamente.